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¿El ácido nicotínico / amida o nucleótidos de flavina formaron parte alguna vez de la secuencia de ARN primaria?

¿El ácido nicotínico / amida o nucleótidos de flavina formaron parte alguna vez de la secuencia de ARN primaria?


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Las reacciones redox de NADH y FADH2 están profundamente arraigadas en nuestra bioquímica. Por ejemplo, los nucleótidos de piridina están involucrados en> 500 reacciones enzimáticas. Cuando miramos la estructura de deamido-NAD +, es sorprendentemente simétrica:

Lo mismo es cierto para FAD, un monstruo de dos cabezas de un nucleótido

en el que podemos reconocer las dos cabezas, pertenecientes a xantosina (un nucleótido de purina) y alfa-ribazol 5'-fosfato, el último de los cuales se produce a partir de flavina en el curso de la síntesis de B12:

La fosforribosa se puede intercambiar entre alfa-ribazol 5'-fosfato y ácido nicotínico.

Dadas estas sugerentes pistas, es tentador especular que uno o más de estos nucleótidos podrían ser tan fundamentales porque en realidad eran parte de alguna secuencia primaria de ARN antiguo, que le da al ARN que contiene este código el poder de realizar una química catalítica seria con grupos ácidos y amida, opciones poderosas para la actividad redox y metiltransferasa y más.

Sé que esta es una pregunta difícil de responder, pero ¿hay cualquier evidencia que influye, o podría influir, sobre si esto sucedió? Por ejemplo, si estos grupos funcionales son demasiado inestables con respecto a las reacciones intramoleculares en una hebra de ARN, o si no hay forma de imaginar un par de bases potencial que se distinguiría de manera confiable de los pares de bases conocidos. O si la edición de ARN a veces los crea en algún organismo. O si los aptámeros hechos a partir de estas subunidades muestran posibilidades catalíticas mejoradas. (No parece tan fácil de buscar, ya que muchos periódicos buscan aptámeros vinculante estos como grupos protésicos, en lugar de incorporando ellos) Sería útil simplemente tener una noción de qué evidencia para tal idea Mira igual que.


Hay ARN de origen natural que contienen una "tapa" de NAD en el extremo 5 '(Bird et al., 2018; Wang et al., 2019).

No pude encontrar ningún artículo sobre ARN naturales con nicotinamida o flavina como base regular. Sin embargo, un estudio con oligonucleótidos sintéticos informa que los oligonucleótidos que contienen NAD pueden formar estructuras triplex estables (Göckel & Richert, 2015).

Hay dos estudios de la década de 1970 que exploran el potencial de emparejamiento de bases de flavina. Raszka y Kaplan (1974) informan que FMN puede formar enlaces de hidrógeno con AMP pero no con otros nucleótidos. Además, exploran este hallazgo para demostrar que FAD puede formar enlaces de hidrógeno intramoleculares. Scarbrough et al (1976) muestran que los nucleótidos que contienen flavina pueden formar una interacción de apilamiento además del tipo de pares de bases de enlaces de hidrógeno. (Compare los enlaces D-X)

Más recientemente, Julius et al. (2020) han demostrado que NAD y FAD pueden actuar como cofactores de primasa para iniciar la replicación del ADN.

En general, parece plausible que FAD y NAD formen parte de cadenas de nucleótidos (más plausible para el ARN, ya que ya se sabe que contienen una variedad de bases inusuales). Sin embargo, no puedo comentar si realmente jugaron ese papel durante la evolución celular.


Ver el vídeo: Differences between DNA and RNA. Expert level to beginners IN 5 MINUTES (Julio 2022).


Comentarios:

  1. Radolf

    de ningún modo

  2. Kirk

    En mi opinión no tienes razón. Puedo defender la posición.

  3. Porteur

    Excelente mensaje))

  4. Amphiaraus

    Sí, se ha decidido.



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