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11.E: Genómica y Biología de Sistemas (Ejercicios) - Biología

11.E: Genómica y Biología de Sistemas (Ejercicios) - Biología


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Estos son ejercicios de tarea para acompañar el TextMap "Online Open Genetics" de Nickle y Barrette-Ng. Incluye el estudio de los genes, en sí mismos, cómo funcionan, interactúan y producen las características visibles y medibles que vemos en los individuos y poblaciones de especies a medida que cambian de una generación a la siguiente, con el tiempo y en diferentes entornos.

Preguntas de estudio

11.1 ¿Cuáles son las ventajas de las técnicas ómicas de alto rendimiento en comparación con el estudio de un solo gen o proteína a la vez? Cuales son las desventajas

11.2 ¿Cómo se vería el cromatograma de un secuenciador capilar si accidentalmente agregara solo plantilla, cebadores, polimerasa y terminadores fluorescentes a la reacción de secuenciación?

11.3 ¿Cuáles son las ventajas y desventajas de la secuenciación clon por clon frente a la secuenciación escopeta del genoma completo?

11.4 ¿Cómo podría utilizar la secuenciación de ADN para identificar nuevas especies de microorganismos marinos?

11.5 Explique cómo podría usar un microarreglo para identificar genes de trigo que han alterado la expresión durante la sequía.

11.6 Una micromatriz identificó 100 genes cuyas transcripciones son abundantes en los tumores, pero ausentes en los tejidos normales. ¿Alguna o todas estas transcripciones causan cáncer? Explica tu respuesta.

11.7 ¿Cómo puede asegurarse de que cada punto impreso en una micromatriz contenga ADN de un solo gen?

11.8 ¿Cómo se verían las manchas en una micromatriz después de la hibridación, si cada mancha contuviera una mezcla aleatoria de genes?

11.9 ¿Cómo se verían las manchas si la hibridación del ADN marcado en verde y rojo se hiciera con un rigor bajo?


Biología celular y del desarrollo

El énfasis de CDB con pistas en Biología Celular y de Sistemas y Biología Médica y Fisiología es muy adecuado para aquellos interesados ​​en la investigación básica, las ciencias médicas y de la salud y en la enseñanza. Las células son la unidad más básica de la vida. Albergan ADN, producen proteínas, producen energía, proporcionan estructura, transmiten información neuronal y, a veces, causan enfermedades. La espectacular variedad de estructuras y funciones que realizan las células está habilitada por el proceso de desarrollo, que coordina los cambios celulares fundamentales y diversos y, como mucho, produce un organismo complejo completo como nosotros a partir de una simple célula inicial.

Armados con una variedad de métodos modernos, que incluyen microscopía avanzada y enfoques genómicos poderosos, los biólogos celulares y del desarrollo descubren las señales moleculares que son responsables de las estructuras complejas dentro de las células, sus funciones y los cambios sorprendentes que experimentan durante el desarrollo. La facultad de Biología Celular y del Desarrollo de Berkeley está a la vanguardia del estudio en una variedad de temas importantes que incluyen el desarrollo de células madre, el cáncer y la disfunción celular, y la comprensión de los mecanismos que permiten que las células se dividan, se muevan, detecten y transmitan señales, y regenerado.

Requisitos de la división superior

MCB 133L: Laboratorio de Biología Celular y Fisiología (Fa, Sp 4 un)

O MCB 170L: Laboratorio de Biología Molecular y Celular (Su solo 4 un)

MCB 133L: Laboratorio de Biología Celular y Fisiología (Fa, Sp 4 un)

O MCB 170L: Laboratorio de Biología Molecular y Celular (Su solo 4 un)


Petición para sustituir MCB 133L con unidades de investigación

Los estudiantes pueden solicitar la sustitución del curso de laboratorio con conocimientos y unidades equivalentes obtenidos a través de la experiencia de investigación independiente (como investigación 199 o H196), según lo determine el Asesor Principal de la Facultad de su énfasis principal. Una consideración cuidadosa y una discusión con su asesor de la facultad son importantes al tomar la decisión de utilizar la investigación independiente para sustituir el laboratorio, ya que los laboratorios de MCB exponen a los estudiantes a muchos enfoques biológicos que no siempre se encuentran durante estos proyectos de investigación. Para obtener más información sobre el proceso de aprobación, consulte Petición para sustituir el curso de laboratorio de MCB.

Ejemplos de planes de 4 años

Estos son solo ejemplos, para obtener más programas de muestra, incluido el inicio de primavera y la transferencia, consulte guide.berkeley.edu o reúnase con un asesor para explorar sus opciones. Los asesores y profesores de MCB recomiendan tomar el laboratorio de la división superior lo antes posible si está interesado en la investigación y / o la investigación con honores.

Pista 1: Biología de sistemas de células y amplificadores Pista 2: Biología y fisiología médica
Año 1 Año 1
Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas
Matemáticas 10A 4 Matemáticas 10B 4 Matemáticas 10A 4 Matemáticas 10B 4
Química 1A / 1AL 4 Chem 3A / 3AL 5 Química 1A / 1AL 4 Chem 3A / 3AL 5
Año 2 Año 2
Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas
Chem 3B / 3BL 5 Biología 1A / 1AL 5 Chem 3B / 3BL 5 Biología 1A / 1AL 5
Biología 1B 4 Física 8A 4 Biología 1B 4 Física 8A 4
Año 3 Año 3
Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas
Física 8B 4 MCB 104 4 Física 8B 4 MCB 104 4
MCB 102 4 MCB 130 4 MCB 102 4 Optativa B 3-4
4to año Cuarto año
Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas Otoño Naciones Unidas Primavera Naciones Unidas
MCB 133L 4 Electiva A 3-4 Electiva B 3-4 MCB 133L 4
Electiva A 3-4 MCB 136 4

Listas de electivas aprobadas

Lista electiva A del CDB

Lista electiva B del CDB

Biología molecular y celular

  • Patogenia bacteriana C103 (Sp, 3 unidades)
  • C112 Microbiología general (F, Su 4 unidades)
  • C114 Introducción a la virología comparada (Sp, 4 unidades)
  • C116 Diversidad microbiana (F, 3 unidades)
  • 132 Biología del cáncer humano (F, 4 unidades)
  • C134 Cromosoma Biología / Citogenética (Sp, 3 unidades)
  • 135A Endocrinología molecular (F 3 unidades)
  • 136 Fisiología (F, Sp 4 unidades)
  • 137L Biología física de la célula (Sp, 3 unidades)
  • 141 Biología del desarrollo (Sp, 3 unidades)
  • C148 Genómica microbiana y genética de amp (Sp, 4 unidades)
  • 149 El genoma humano (F, 3 unidades)
  • 150 Inmunología Molecular (F, Sp, 4 unidades)
  • 153 Terapéutica molecular (F, 4 unidades)
  • 160 Neurobiología Celular y Molecular (F, 4 unidades)
  • 161 Neurociencia de Circuitos, Sistemas y Comportamiento (Sp, 4 unidades)
  • 165 Neurobiología de la enfermedad (Sp, 3 unidades)
  • 166 Neurobiología Biofísica (F, 3 unidades)

Biología molecular y celular

  • Patogenia bacteriana C103 (Sp, 3 unidades)
  • C112 Microbiología general (F, Su 4 unidades)
  • C114 Introducción a la virología comparada (Sp, 4 unidades)
  • C116 Diversidad microbiana (F, 3 unidades)
  • 130 Biología Celular y de Sistemas (Sp, 4 unidades)
  • 132 Biología del cáncer humano (F, 4 unidades)
  • C134 Cromosoma Biología / Citogenética (Sp, 3 unidades)
  • 135A Endocrinología molecular (F 3 unidades)
  • 137L Biología física de la célula (Sp, 3 unidades)
  • 141 Biología del desarrollo (Sp, 3 unidades)
  • C148 Genómica microbiana y genética de amp (Sp, 4 unidades)
  • 149 El genoma humano (F, 3 unidades)
  • 150 Inmunología Molecular (F, Sp, 4 unidades)
  • 153 Terapéutica molecular (F, 4 unidades)
  • 160 Neurobiología Celular y Molecular (F, 4 unidades)
  • 161 Neurociencia de Circuitos, Sistemas y Comportamiento (Sp, 4 unidades)
  • 165 Neurobiología de la enfermedad (Sp, 3 unidades)
  • 166 Neurobiología Biofísica (F, 3 unidades)

Biología Integrativa

  • 103LF Zoología de invertebrados (Sp, 5 unidades)
  • 104LF Historia natural de los vertebrados (Sp, 5 unidades)
  • 117 & amp 117LF Etnobotánica médica con laboratorio (F, Do, 2 y amp 2 unidades) *
  • 123AL Fisiología ambiental y del ejercicio (F, 5 unidades)
  • 131 Anatomía Humana General (F, Su, 3 unidades)
  • 137 Endocrinología humana (F, 4 unidades)
  • 140 Biología de la Reproducción Humana (Sp, 4 unidades)
  • Relojes biológicos C143A: fisiología y comportamiento (Alt F, 3 unidades)
  • C143B Hormonas y comportamiento (Sp, 3 unidades)
  • 148 Fisiología animal comparada (Alt F, 3 unidades)
  • * Deben tomarse cursos de lectura y de laboratorio para IB 117 / 117L para obtener un requisito electivo

Ciencias de la nutrición y toxicología

  • 103 Función de nutrientes y metabolismo del amplificador (F, 3 unidades)
  • 108A Introducción y aplicación de la ciencia de los alimentos (F, 3 unidades)
  • 110 Toxicología (F, 4 unidades)
  • 160 Bases metabólicas de la salud y las enfermedades humanas (Sp 4 unidades)
  • 161A Terapia de Nutrición Médica I (F 4 unidades)

Biología vegetal y microbiana

  • 135 Fisiología y bioquímica de plantas (F 3 unidades)
  • 150 Biología de células vegetales (F 3 unidades)
  • 160 Genética Molecular Vegetal (Sp 3 unidades)
  • 110 Introducción a la Psicología Biológica (F, Sp, Su 3 unidades)
  • Relojes biológicos C113: fisiología y comportamiento (Alt F 3 unidades)
  • C116 Hormonas y comportamiento del amplificador (Sp 3 unidades)

Salud pública

  • 141 Introducción a la bioestadística (Su 5 unidades)
  • 142 Introducción a la probabilidad y las estadísticas en bio y salud pública (unidades F, Sp 4) - Nota: Para los estudiantes que hayan completado Matemáticas 10A / B, o Estadística 2 o 20, este curso no se acepta para cumplir con el requisito electivo.
  • 150B Introducción a las ciencias de la salud ambiental (F 3 unidades)
  • 162A Microbiología de salud pública (F, Su 4 unidades)

Cursos aprobados pero NO ofrecidos con regularidad

  • MCB 113 Microbiología aplicada y bioquímica
  • MCB 115 Biología molecular del virus animal
  • MCB 137 Simulación por computadora en biología (reemplazado por MCB 137L)
  • MCB 143 Evolución de genomas, células y desarrollo de amplificadores (F, 3 unidades)
  • MCB 163 Neuroanatomía de mamíferos
  • MCB 167 Bases fisiológicas y genéticas del comportamiento
  • MCB C145 Genómica
  • MCB C146 Temas en Biología Computacional y Genómica
  • NSTX 150 Mecánica de la regulación metabólica
  • PH 150A Introducción a la epidemiología y las enfermedades humanas

Reserva Mandir

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Programación lineal entera en biología computacional y de sistemas

Este libro ha sido citado por las siguientes publicaciones. Esta lista se genera en base a los datos proporcionados por CrossRef.
  • Editorial: Cambridge University Press
  • Fecha de publicación en línea: mayo de 2019
  • Año de publicación impresa: 2019
  • ISBN en línea: 9781108377737
  • DOI: https://doi.org/10.1017/9781108377737
  • Materias: Genómica, Bioinformática y Biología de Sistemas, Ciencias de la Vida, Informática, Biología Computacional y Bioinformática

Envíe un correo electrónico a su bibliotecario o administrador para recomendarle que agregue este libro a la colección de su organización.

Descripción del libro

La programación lineal entera (ILP) es una técnica versátil de modelado y optimización que se utiliza cada vez más de formas no tradicionales en biología, con el potencial de transformar la computación biológica. Sin embargo, pocos biólogos lo conocen. Este texto de cómo y por qué presenta la ILP a través de la lente de la biología computacional y de sistemas. Utiliza ejemplos detallados de genómica, filogenética, ARN, plegamiento de proteínas, análisis de redes, cáncer, ecología, coevolución, secuenciación de ADN, análisis de secuencias, inferencia de pedigrí y hermanos, haplotipado y más, para establecer el poder de la ILP. Este libro tiene como objetivo enseñar la lógica de modelar y resolver problemas con ILP, y enseñar el "flujo de trabajo" práctico involucrado en el uso de ILP en biología. Escrito para una amplia audiencia, sin prerrequisitos biológicos o computacionales, este libro es apropiado para cursos de nivel de entrada y avanzados dirigidos a estudiantes biológicos y computacionales, y como fuente para especialistas. Numerosos ejercicios y el software que los acompaña (en Python y Perl) demuestran los conceptos.

Reseñas

“En su clásico estilo de enseñanza accesible, Gusfield nos enseña por qué la programación lineal entera (ILP) es la idea matemática más útil de la que probablemente nunca haya oído hablar. Lea este libro para aprender cómo lo que no sabe puede lastimarlo y por qué ILP debería ser su nuevo método favorito '.

Trey Ideker - Universidad de California, San Diego

Una vez más, Dan Gusfield ha escrito un libro accesible que muestra que no es necesario sacrificar el rigor algorítmico al resolver problemas del mundo real. Explica la programación lineal entera en el contexto de la biología del mundo real. Al hacerlo, el lector tiene una comprensión enriquecida tanto de los detalles algorítmicos como de los desafíos de la biología moderna '.


Genómica y el marco 4 M

Dos aspectos distinguen la ciencia de datos en las ciencias naturales del contexto de las ciencias sociales. En primer lugar, en las ciencias naturales muchos de los datos son cuantitativos y estructurados; a menudo se derivan de lecturas de sensores de sistemas experimentales y observaciones en condiciones bien controladas. Por el contrario, los datos en las ciencias sociales suelen estar desestructurados y se derivan de observaciones más subjetivas (por ejemplo, entrevistas y encuestas). En segundo lugar, las ciencias naturales también tienen modelos químicos, físicos y biológicos subyacentes que a menudo son altamente matemáticos y predictivos.

En consecuencia, la minería de la ciencia de datos en las ciencias naturales está íntimamente asociada con el modelado matemático. Una forma sucinta de entender esta relación es el marco de 4 M, desarrollado por Lauffenburger [39]. Este concepto describe el proceso general en biología de sistemas, estrechamente relacionado con la genómica, en términos de (i) medir la cantidad, (ii) minería a gran escala, que es lo que a menudo pensamos como ciencia de datos, (3) modelar lo extraído observaciones, y finalmente (4) Manipular o probar este modelo para asegurar que sea exacto.

El enfoque híbrido de combinar la minería de datos y el modelado biofísico es una forma razonable de avanzar para la genómica (Fig. 1b). La integración de mecanismos físico-químicos en el aprendizaje automático proporciona una interpretación valiosa, aumenta la eficiencia de los datos en el aprendizaje (por ejemplo, mediante el aumento del conjunto de entrenamiento y los antecedentes informativos) y permite la extrapolación de datos cuando las observaciones son costosas o imposibles [40]. Por otro lado, la minería de datos puede estimar con precisión los parámetros del modelo, reemplazar algunas partes complejas de los modelos donde las teorías son débiles y emular algunos modelos físicos para la eficiencia computacional [41].

La previsión meteorológica a corto plazo como ejemplo de este enfoque híbrido es quizás lo que busca la genómica. Para esta disciplina, las predicciones se basan en datos de sensores de todo el mundo y luego se fusionan con modelos físicos. El pronóstico del tiempo fue, de hecho, una de las primeras aplicaciones de la computación a gran escala en la década de 1950 [42, 43]. Sin embargo, fue un fracaso absoluto intentar predecir el clima basándose únicamente en modelos físicos. Rápidamente se descubrió que las predicciones solo eran correctas durante un corto período de tiempo, principalmente debido a la importancia de las condiciones iniciales. Ese intento imperfecto contribuyó al desarrollo de los campos de la dinámica no lineal y el caos, ya la acuñación del término “efecto mariposa” [43]. Sin embargo, los años siguientes transformaron drásticamente la predicción meteorológica en una gran historia de éxito, gracias a la integración de modelos físicos con grandes conjuntos de datos medidos por satélites, globos meteorológicos y otros sensores [43]. Además, la apreciación del público por los aspectos probabilísticos de un pronóstico del tiempo (es decir, la gente se viste apropiadamente en función de la probabilidad de lluvia) presagia cómo podría responder a los "pronósticos de salud" probabilísticos basados ​​en la genómica.


Comprender la respuesta al ejercicio de resistencia mediante un enfoque de biología de sistemas: combinación de metabolómica sanguínea, transcriptómica y miRNómica en caballos

Fondo: El ejercicio de resistencia en caballos requiere procesos adaptativos que involucran respuestas fisiológicas, bioquímicas y cognitivo-conductuales en un intento por recuperar la homeostasis. Planteamos la hipótesis de que la identificación de las relaciones entre el metaboloma sanguíneo, el transcriptoma y el miRNome durante el ejercicio de resistencia en caballos podría proporcionar información significativa sobre la respuesta molecular al ejercicio de resistencia. Por esta razón, los datos del metaboloma sérico y del transcriptoma de sangre completa y miRNome se obtuvieron de diez caballos antes y después de una competencia de resistencia de 160 km.

Resultados: Obtuvimos una red reguladora global basada en 11 metabolitos únicos, 263 genes metabólicos y 5 miARN cuya expresión se alteró significativamente en T1 (competencia posterior a la resistencia) en relación con T0 (línea de base, competencia previa a la resistencia). Esta red proporcionó nuevos conocimientos sobre la conversación cruzada entre las distintas vías moleculares (por ejemplo, detección de energía y oxígeno, estrés oxidativo e inflamación) que no eran detectables al analizar metabolitos individuales o transcripciones por sí solas. Los metabolitos individuales y las transcripciones desempeñaban múltiples funciones y, por lo tanto, compartían varias vías bioquímicas. Utilizando un análisis métrico del factor de impacto regulatorio, esta red reguladora se confirmó aún más en los niveles de factor de transcripción y miARN. En una cohorte extendida de 31 animales independientes, el análisis de factores múltiples confirmó las fuertes asociaciones entre lactato, derivados de metileno, miR-21-5p, miR-16-5p, la familia let-7 y genes que codifican proteínas involucradas en reacciones metabólicas principalmente relacionadas con respuesta inmune de energía, ubiquitina proteasoma y lipopolisacárido después de la competencia de resistencia. El análisis de factores múltiples también identificó biomarcadores potenciales en T0 para una mayor probabilidad de no terminar una competencia de resistencia.

Conclusiones: Hasta donde sabemos, el presente estudio es el primero en proporcionar una descripción general completa e integrada de las redes de corregulación del metaboloma, el transcriptoma y el miRNome que pueden tener un papel clave en la regulación de la respuesta metabólica e inmune al ejercicio de resistencia en caballos. .

Palabras clave: Ejercicio de resistencia Metaboloma del caballo Análisis de factores múltiples Reguloma Biología de sistemas Transcriptoma miRNome.

Cifras

Regulación metabólica en la célula ...

Regulación metabólica en la célula después del ejercicio de resistencia. El ejercicio de resistencia aumentó la producción ...

Red reguladora que une metabolitos, metabólicos ...

Red reguladora que une metabolitos, genes metabólicos y miARN. Identificamos un total de ...

Activadores y represores del ...

Activadores y represores de la red reguladora. a La red reguladora fue impulsada ...

Gráfica de proyección de análisis de factores múltiples ...

Gráfica de proyección de análisis de factores múltiples en T0 en una cohorte independiente de 13…

Gráfica de proyección de análisis de factores múltiples ...

Gráfica de proyección de análisis de factores múltiples en T1 en una cohorte independiente de 31…

Un modelo para el aumento intestinal ...

Un modelo para aumentar la permeabilidad intestinal después del ejercicio basado en metabolitos coordinados y ...


Ejercicios de bioinformática

Descargar proteoma de Halobacterium spec. con wget y míralo:

a) ¿Cuántas proteínas predichas hay?

b) ¿Cuántas proteínas contienen el patrón & # 8220WxHxxH & # 8221 o & # 8220WxHxxHH & # 8221?

c) Use la función de búsqueda (/) en & # 8216less & # 8217 para pescar los ID de proteína que contienen el patrón o hágalo de manera más elegante con awk:

a) Genere una lista de ID de secuencia para el resultado de coincidencia de patrón anterior

(es decir, recuperar my_IDs del paso 2c). Alternativamente, descargue el archivo pregenerado con wget.

5. Observando varios patrones diferentes:

a) Genere varias listas de ID de secuencia a partir de varios resultados de coincidencia de patrones (es decir, recuperar

e a.my_ids, b.my_ids y c.my_ids del paso 2c).

b) Recupere las secuencias en un paso usando fastacmd en un bucle for: 6. Ejecute blastall con algunas proteínas en myseq.fasta contra su base de datos de proteoma de Halobacterium recién creada. Cree primero un archivo de salida de voladura completo que incluya alineaciones. En un segundo paso, utilice la opción & # 8216m -8 & # 8217 para obtener una salida tabular (es decir, valores separados por tabulaciones).

Las descripciones archivadas de la explosión salida tabular (del & # 8220-m 8& # 8221 opción) están disponibles aquí.


Departamento de Biología

La biología ha tenido décadas de liderazgo extraordinario que le ha servido bien y ha resultado en el diseño de programas holísticos para preparar a los estudiantes para estudios de posgrado, profesiones de la salud, educación científica y otras carreras relacionadas con las ciencias. La misión del Departamento de Biología está en consonancia con la misión y los objetivos de la Universidad, especialmente en lo que se refiere al desarrollo de los líderes del mañana en las profesiones que utilizan el conocimiento biológico. La especialización brinda instrucción en conceptos biológicos fundamentales, inmersión en ejercicios prácticos y mentales de campo y de laboratorio, y oportunidades para una mayor especialización en campos emergentes como la biofísica, la biología computacional y la genómica. El razonamiento crítico, la investigación intelectual y el dominio de la jerga científica se fomentan agresivamente en el programa de biología. Desde el principio, los estudiantes se involucran en la práctica de la investigación científica y, en los cursos avanzados, se sienten motivados para formular hipótesis comprobables, diseñar experimentos y analizar datos. Estas competencias se demuestran luego en el curso culminante de BIOL, Seminario para estudiantes de último año de BIOL401, en el que los estudiantes ofrecen una presentación científica de alta calidad y preguntas de campo que pueden ser planteadas por cualquier miembro de la facultad de BIOL. El programa promueve el liderazgo y las habilidades colaborativas a través de proyectos grupales que incluyen recitaciones / preceptos, discusiones, experimentos de laboratorio e informes. Los estudiantes universitarios avanzados pueden servir como asistentes de enseñanza y laboratorio. El departamento apoya un capítulo de Beta Kappa Chi, el Club de Biología y el Programa de Asesoramiento de Carreras de Salud Preprofesionales. Estas organizaciones centradas en los estudiantes ofrecen oportunidades de liderazgo y servicio.

Declaración de la visión

La especialización en biología está diseñada para: brindar a los estudiantes una amplia comprensión de los procesos, conceptos y estructuras que caracterizan la vida en tres niveles básicos: molecular / celular, sistema / organismo y comunidad / ecosistema fomentar la investigación científica y la experimentación a través de experiencias de laboratorio y de campo e investigación auténtica e independiente y, por último, preparar a los estudiantes para la consecución de estudios de posgrado o profesionales, o para carreras en el cuidado de la salud, investigación pública y privada, docencia y campos relacionados.

PROGRAMAS DE GRADO

El plan de estudios básico de biología requiere la finalización de dos cursos introductorios obligatorios (cr. Hr = 8) dentro del primer año, después de lo cual los estudiantes pueden seleccionar de 5 a 7 cursos avanzados de biología (cr. Hr = 19 - 28) según sus intereses y metas profesionales. con la restricción de que se tome al menos un curso en cada una de las tres categorías principales de biología (es decir, organismo / fisiología, celular y molecular, y medio ambiente / ecología / evolución).

1. Un "núcleo" obligatorio de nueve cursos de biología con laboratorios que representan tres niveles de procesos de la vida:

  • tres cursos introductorios con laboratorios (BIOL120 / 121, BIOL230 / 231)
  • biología molecular y celular (BIOL250 / 251)
  • cinco asignaturas optativas de biología con contenido avanzado en cada uno de los tres niveles

2. Seminario para personas mayores
3. Cuatro cursos obligatorios de química
4. Dos cursos obligatorios de matemáticas
5. Dos cursos obligatorios de física

Estudio de posgrado en biología

El programa de estudios de posgrado en biología conduce a la Maestría en Ciencias. La oferta de un título de posgrado en biología tiene varios propósitos. Una de ellas es ofrecer a los estudiantes que hayan obtenido el título de bachillerato en biología u otras ciencias naturales la oportunidad de ampliar y aumentar sus conocimientos en las ciencias biológicas. Otra es la oportunidad para que los estudiantes ingresen o amplíen su experiencia en el área de la investigación experimental en biología. Estos objetivos pueden lograrse mediante la selección de cursos electivos que se ofrecen en este departamento y áreas afines (química, agricultura, medicina veterinaria, etc.), y mediante la selección de un área de investigación de concentración. Este último es con la ayuda de un asesor principal del departamento que normalmente actuará como profesor principal del estudiante. Todos los estudiantes graduados deben enseñar durante un (1) año en el Programa de Biología de primer año.

SRA. en biología

El programa de posgrado en biología está diseñado para preparar a los estudiantes para futuros trabajos de posgrado que conduzcan a un doctorado. proporcionar a los biólogos profesionales oportunidades de investigación y educación avanzadas y proporcionar a los estudiantes un programa de posgrado de base amplia que permita la especialización en los diversos campos de investigación representados por la facultad del departamento. ¡El procedimiento de solicitud es sencillo!

Doctor. en Biociencias Integrativas

Los avances en las ciencias de la vida que abordan los desafíos locales y globales requieren nuevos enfoques para la educación y la investigación de posgrado. El doctorado en Biociencias Integrativas (IBS) de la Universidad de Tuskegee. El programa está diseñado para desarrollar profesionales que no solo tengan competencia técnica, sino que también posean la flexibilidad y adaptabilidad para abordar las complejidades de los desafíos actuales. Lea sobre nuestra misión, visión y colaboradores de este programa.

DESARROLLO PROFESIONAL

El Centro de Recursos de Aprendizaje (LRC), ubicado en el salón 207 Armstrong Hall, contiene una biblioteca de información sobre las escuelas de medicina y sus planes de estudio, los requisitos de admisión y la planificación financiera a la que cualquier estudiante puede acceder como referencia (biología o no biología) . Hay información similar disponible sobre otros programas como Odontología, Optometría, Farmacia, Fisioterapia, Asistente médico y Salud pública. El Centro también contiene información impresa y computarizada sobre MCAT, GRE y otros exámenes estandarizados, así como información sobre programas de investigación / enriquecimiento de verano y programas de posgrado. Las solicitudes para estos exámenes y programas están disponibles en el Centro.

PROGRAMA DE ASESORÍA DE CARRERAS DE SALUD PRE-PROFESIONALES

El Programa Asesor de Carreras de Salud Preprofesionales (PHCAP) se estableció para ayudar a los estudiantes en el proceso de solicitudes para carreras de salud. Hay una serie de talleres, reuniones y sesiones privadas que garantizarán que cada estudiante tenga una aplicación completa.

MEMORANDOS DE ENTENDIMIENTO (MOU)

La Facultad de Artes y Ciencias de la Universidad de Tuskegee tiene asociaciones con varias instituciones médicas en todo el país con Programas de Aceptación Temprana.

OFICINA DE INVESTIGACIÓN DE PREGRADO

La Oficina de Investigación de Pregrado (OUR) se centra en exponer a los estudiantes a carreras y pasantías basadas en la investigación. Se organizan varios seminarios para permitir que los estudiantes tengan un contacto directo con técnicas de laboratorio y profesionales en funcionamiento que los harán exitosos en el futuro.

El Programa de Carreras de Investigación está coordinado por la Dra. Marcia Martinez. El propósito del programa es ayudar a los profesores involucrados en la investigación biomédica en la Universidad de Tuskegee con el desarrollo de programas de investigación competitivos, así como aumentar el número de minorías subrepresentadas en la Universidad de Tuskegee que realizan investigación biomédica. El programa se estableció para aumentar el acceso a los laboratorios de investigación, asistir a reuniones científicas nacionales, establecer seminarios biomédicos para profesores y estudiantes y promover la investigación de los estudiantes a través de la tutoría. Los estudiantes matriculados en investigación de pregrado pueden obtener experiencia de miembros de la facultad en Biología o de otros departamentos biomédicos en el campus. Algunas de las investigaciones realizadas en el campus tienen énfasis en el cáncer, la toxicología o la fisiología reproductiva.

El Proyecto MICROBE tiene como objetivo mejorar la exposición de los estudiantes de pregrado a la investigación dentro y fuera de la sala de conferencias. Este programa de investigación de pregrado busca brindar más oportunidades para que los estudiantes realicen investigaciones durante el año académico.


Reseñas y endosos de amplificadores

'Models of Life es una visión de un físico sobre los mecanismos reguladores biológicos. Proporciona una base cuantitativa de cuántos de los sistemas biológicos funcionan. Usando lógica y matemáticas simples, Kim Sneppen, un científico y pensador de renombre mundial, ha creado una lectura obligada para los investigadores en biología cuantitativa. El libro proporciona una explicación clara de experimentos triunfantes de una manera lúcida con figuras nítidas. La brillantez de la mente analítica del autor se muestra cuando uno ve cómo explica algunos de los emocionantes sistemas reguladores paradigmáticos, comenzando con los conceptos básicos de la biología molecular. El libro también está repleto de preguntas problemáticas intelectualmente desafiantes para los lectores, lo que hace que el libro también sea un texto excelente para los estudiantes '. Sankar Adhya, Instituto Nacional del Cáncer, Maryland

'El libro perspicaz de Kim Sneppen cubre mucho terreno en la descripción de sistemas biológicos en diferentes escalas de tiempo y longitud y niveles de resolución. Sus diferentes capítulos unificados por la filosofía de modelado del autor seguramente serán de interés para un grupo muy diverso de lectores ... Los lectores interesados ​​en el modelado basado en agentes encontrarán que se aplica a sistemas tan diversos como la epigenética, la propagación de información y los patrones evolutivos en registros fósiles. . Los capítulos dedicados combinan biofísica y biología de sistemas de regulación génica e interacciones proteína-proteína. El libro proporciona una cobertura especialmente profunda de la biología de los fagos, las bacterias y sus interacciones dentro de los ecosistemas. Sería un excelente libro de texto para uno o incluso varios cursos universitarios sobre sistemas o biología evolutiva. De hecho, al impartir estos cursos, lo utilizaré mucho yo mismo y lo recomendaré a mis alumnos ”. Sergei Maslov, Laboratorio Nacional Brookhaven, Nueva York

Sneppen ha escrito un libro maravillosamente amigable y legible sobre los principios de las células biológicas para los físicos. Presenta conceptos y modelos a un nivel lo suficientemente profundo como para transmitir ideas poderosas, mientras mantiene las matemáticas al nivel absolutamente mínimo que se necesita para ser claro e informativo. Este libro es pionero en cubrir un terreno científico que en gran medida no se cubre mucho en otros lugares, pero que lo estará en el futuro, incluida la retroalimentación, la regulación, las redes, la biestabilidad en el conmutador lambda-fago, el bucle de ADN, la difusión en las células, la regulación epigenética y la evolución celular. . Lo recomiendo encarecidamente como un libro profundamente revelador sobre los principios de la biología y una gran lectura '. Ken Dill, Centro Laufer, Universidad Stony Brook


Reseñas y endosos de amplificadores

'Models of Life es una visión de un físico sobre los mecanismos reguladores biológicos. Proporciona una base cuantitativa de cuántos de los sistemas biológicos funcionan. Usando lógica y matemáticas simples, Kim Sneppen, un científico y pensador de renombre mundial, ha creado una lectura obligada para los investigadores de biología cuantitativa. El libro proporciona una explicación clara de experimentos triunfantes de una manera lúcida con figuras nítidas. La brillantez de la mente analítica del autor se muestra cuando uno ve cómo explica algunos de los emocionantes sistemas reguladores paradigmáticos, comenzando con los conceptos básicos de la biología molecular. El libro también está repleto de preguntas problemáticas intelectualmente desafiantes para los lectores, lo que hace que el libro también sea un texto excelente para los estudiantes '. Sankar Adhya, Instituto Nacional del Cáncer, Maryland

'El libro perspicaz de Kim Sneppen cubre mucho terreno en la descripción de sistemas biológicos en diferentes escalas de tiempo y longitud y niveles de resolución. Sus diferentes capítulos unificados por la filosofía de modelado del autor seguramente serán de interés para un grupo muy diverso de lectores ... Los lectores interesados ​​en el modelado basado en agentes encontrarán que se aplica a sistemas tan diversos como la epigenética, la propagación de información y los patrones evolutivos en registros fósiles. . Los capítulos dedicados combinan biofísica y biología de sistemas de regulación génica e interacciones proteína-proteína. El libro proporciona una cobertura especialmente profunda de la biología de los fagos, las bacterias y sus interacciones dentro de los ecosistemas. Sería un excelente libro de texto para uno o incluso varios cursos universitarios sobre sistemas o biología evolutiva. De hecho, al impartir estos cursos, lo utilizaré mucho yo mismo y lo recomendaré a mis alumnos ”. Sergei Maslov, Laboratorio Nacional Brookhaven, Nueva York

'Sneppen has written a wonderfully friendly and readable book on the principles of biological cells for physicists. He presents concepts and models at a level that is sufficiently deep to convey powerful insights, while keeping the math to the absolutely minimal level that is needed to be clear and informative. This book is pioneering in covering scientific terrain that is largely not covered much elsewhere, but will be in the future - including feedback, regulation, networks, bistability in the lambda-phage switch, DNA looping, diffusion in cells, epigenetic regulation and cellular evolution. I highly recommend it as a deeply insightful book about the principles of biology and a great read.' Ken Dill, Laufer Center, Stony Brook University


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